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整合诊断丨淋系血液、淋巴组织肿瘤的微小残留病（MRD）监测——Ig，TCR基因重排的NGS检测2020-07-21 21:01·医脉通血液科MRD已成为风险分层和个体风险导向治疗决策的重要生物标记。对儿童B-ALL患者的大队列研究表明，MRD状态是复发和临床结果的强大预测因子。在成人复发/难治性B-ALL患者中，MRD阴性显著延长总生存期(OS)；MRD状态也被用于指导治疗[1]。NCCN指南将MRD描述为治疗响应的评估重要组成部分，建议在完成初始诱导后对ALL成人患者进行MRD检测。NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology Acute LymphoblasticLeukemia V1 2020血液肿瘤已进入个体化精准治疗时代。然而，如何对肿瘤细胞或克隆进行精准的监测、何时采取预防或早期的干预措施，仍是待解决的问题。而重要的解决方案之一，在于寻找简便、可靠的可作为微小残留病(MRD)检测的标志物与检测手段。微小残留病(minimal residual disease，MRD)是指按目前的治疗标准经治疗取得完全缓解(CR)后体内残存微量肿瘤细胞的状态。血液肿瘤细胞的残留监测依赖于检测方法的灵敏度。传统细胞形态学的检测灵敏度是可以检测5%的肿瘤细胞，在这之下，可能需要一些更灵敏的方法，比如流式检测的灵敏度达到10-3-10-4，分子的检测灵敏度更高一些。从分子检测来讲，MRD可以检测多种指标，包括特定的TCR基因重排，Ig基因重排，融合基因和基因变异等等。淋巴细胞的基本特征之一，即B细胞中Ig基因和T细胞中的TCR基因的重排。基因重排指的是不同的淋巴细胞的Ig或者TCR片段在细胞分化过程中发生的重新排列组合（如图1）。正常淋巴细胞未受任何刺激情况下，其基因重排是随机的，细胞表现为多家族和多克隆性，具有发挥各种细胞免疫作用的潜能。而在淋巴细胞白血病或淋巴瘤发生过程中，淋巴细胞在某一个或几个特定的TCR或Ig基因性重排的细胞中发生转化，导致TCR或Ig基因单克隆性表达，使淋巴细胞呈现为克隆性增殖，导致在淋巴结，外周血或者骨髓细胞中出现1个或2个主要淋巴细胞克隆，为单克隆性，TCR和Ig基因家族的单克隆重排是淋巴瘤细胞群的重要特征。临床上对于重排检测的应用主要在：疾病的辅助诊断与鉴别诊断、治疗后微小残留病（MRD）的监测两方面。图1基于临床的需求，高博诊断中心分子实验室已经开发出基于NGS深度测序法的Ig和TCR基因重排检测MRD的方案。如下述病例，本检测通过对患者初发病理组织进行Ig/TCR基因重排的筛查，确认单克隆重排模式，并通过持续性监测患者特有的阳性克隆在体内的残留，辅助临床判断预后，及时提示复发风险。Ig和TCR基因重排是检测淋巴细胞克隆性增生的金标准，不仅对于淋巴瘤的辅助诊断具有重要意义，还对于急性淋巴细胞白血病、多发性骨髓瘤有着辅助诊断、治疗效果的判断、复发的预测具有重要意义。病例患者张**检测Ig基因重排，初筛时检测到1种阳性克隆性重排，重排情况详见图2。把该重排作为患者MRD动态监测的指标，根据患者的治疗阶段，进行周期性监测，提示疾病进展和预后效果。如图3所示，MRD值在一个半月左右的时间快速上升近100倍，提示患者疾病发生进展，经过相应的治疗后，疾病得到迅速控制，MRD值降低至2000左右，预示良好的治疗效果。图2图3参考文献：J Hematol Oncol. 2018 Aug 22;11(1):105.鸿博股份2月8日晚间披露公司北京AI创新赋能中心的进展：2月3日，北京市朝阳区发改委通知确认子公司英博数科入选北京市重大工程储备项目。在下阶段的工作中，英博数科将以北京AI创新赋能中心智算中心的商业应用和扩容建设为发展重点，将智算中心打造成为具备标杆示范作用的AI产学研基地，也将与战略合作伙伴宣亚国际等就新华社元宇宙项目“山海中国”、以及AIGC相关延展技术的商业应用开发进行落地推进。2月5日，北京AI创新赋能中心核心基础设施AIDC 一期所有设备及配套软件已经全部到货，由英伟达提供的PREMIUMSERVICE也于1月26日全面激活，将于2月16日接受券商及第三方技术监理机构验收探访。